Masarykův onkologický ústav

S MOU som začala spolupracovať v septembri 2021, kedy sme započali prácu na harmonizácii sekvenačných dát v rámci ústavu, čo bola zároveň aj téma mojej diplomovej práce. K riešeniu tohto problému som pristupovala z role tzv. dátového stwearda, ktorého úlohou je zabezpečiť kompatibilitu dát s tzv. FAIR princípmi a umožniť ich znovu-využiteľnosť. Dátový steward sa stará o dáta počas ich celého životného cyklu a zabezpečuje ich kvalitnú správu. 

Mojou úlohou na MOU bolo zmapovať existujúce sekvenačné dáta, popísať ich kľúčovými parametrami, navrhnúť ich správu z dlhodobého hľadiska a zverejniť ich metadáta v katalógu, ktorý by slúžil ako jednotné miesto prístupu k dátam pre výskumníkov. V rámci diplomovej práce vznikol dátový katalóg data.bbmri.cz, ktorý po prihlásení poskytuje výskumníkovi prehľad o tom aké sekvenančé dáta existujú na MOU a umožňuje mu požiadať o ich vydanie na výskumné účely. 

V súčasnosti prebieha proces mapovania rádiologických dát na MOU, ktoré by mali byť v ideálnom prípade pridané do katalógu a ponúkané rovnakým spôsobom ako sekvenačné dáta. Ďalším cieľom je ponúknuť možnosť pripojenia dát ostatných bánk biologického materiálu v ČR do katalógu za účelom vytvorenia národného uzlu medicínskych FAIR dát pre výskum a vývoj.